Takzvaná „magisterka“ je doba mezi studiem filozofie a teologie. Slovo pochází z latinského magisterium. Jde o odkaz na dřívější tradici, kdy scholastici během tohoto období vždy vyučovali na středních školách nebo zastávali funkci prefekta či vychovatele na jezuitských kolejích. V dnešní době jde o přibližně dvouletou dobu praxe, během které má scholastik příležitost žít v nějaké komunitě a účastnit se pastoračního působení jezuitů. Může například pomáhat v děčínské škole Nativity, odjet na zahraniční stáž nebo se podílet na nějakém jiném jezuitském díle. Na tuto dobu obvykle přeruší jakékoli studium, aby tak mohl především získat praktické zkušenosti.